MRI诊断颅脑、脊柱、脊髓病变有重要价值，对关节软组织损伤如判断半月板、交叉韧带损伤等诊断方面优于CT；对于五官疾病、心脏疾病、纵隔肿块、骨关节和肌肉病变有很大价值，对于腹部实体器官（如肝、脾、胰腺、肾脏、肾上腺）及盆腔内器官（如子宫、卵巢、膀胱、前列腺）的病变有重要价值，在前列腺癌的早期诊断方面有突出价值。MRI对人体没有电离辐射损伤。